Using global team science to identify genetic Parkinson's disease worldwide.

Fue publicado el artículo en el que participa Uruguay:

Ann Neurol. 2019 Jun 2. doi: 10.1002/ana.25514. [Epub ahead of print]

Using global team science to identify genetic Parkinson's disease worldwide.

Vollstedt EJ1, Kasten M1,2, Klein C1; MJFF Global Genetic Parkinson's Disease Study Group.

Collaborators (209)
Aasly J, Adler C, Ahmad-Annuar A, Albanese A, Alcalay R, Al-Mubarak B, Alvarez V, Andree-Muñoz B, Annesi G, Appel-Cresswell S, Arkadir D, Armasu S, Barber TR, Bardien S, Barkhuizen M, Barrett MJ, BaŞak AN, Beach T, Benitez BA, Berg D, Bhatia K, Binkofski F, Blauwendraat C, Bonifati V, Borges V, Bozi M, Brice A, Brighina L, Brockmann K, Brüggemann N, Camacho M, Cardoso F, Belin AC, Carr J, Chan P, Chang-Castello J, Chase B, Chen-Plotkin A, Chung SJ, Cilia R, Clarimon J, Clark L, Cornejo-Olivas M, Corvol JC, Cosentino C, Cras P, Crosiers D, Damásio J, Das P, de Carvalho Aguiar P, De Michele G, De Rosa A, Dieguez E, Dorszewska J, Erer S, Ertan S, Farrer M, Fedotova E, Ferese R, Ferrarese C, Ferraz H, Fiala O, Foroud T, Friedman A, Frigerio R, Funayama M, Gambardella S, Garraux G, Gatto EM, Genç G, Goldwurm S, Gomez-Esteban JC, Gómez-Garre P, Gorostidi A, Grosset D, Hanagasi H, Hardy J, Hassan A, Hattori N, Hauser RA, Hedera P, Hentati F, Hertz JM, Holton JL, Houlden H, Hutz MH, Ikeuchi T, Illarioshkin S, Inca-Martinez M, Infante J, Jankovic J, Jeon BS, Jesús S, Jimenez-Del-Rio M, Kasten M, Kataoka H, Kawakami H, Kim YJ, Klein C, Klivényi P, Koks S, König IR, KostiĆ V, Koziorowski D, Krüger R, Krygowska-Wajs A, Kulisevsky J, Lang A, LeDoux M, Lesage S, Lim SY, Lin CH, Lohmann K, Lopera F, Lopez G, Lu CS, Lynch T, Machaczka M, Madoev H, Magalhães M, Majamaa K, Maraganore D, Marder K, Markopoulou K, Martikainen MH, Mata I, Mazzetti P, Mellick G, Menéndez-González M, Micheli F, Mirelman A, Mir P, Morino H, Morris H, Munhoz RP, Naito A, Olszewska DA, Ozelius LJ, Padmanabhan S, Paisán-Ruiz C, Payami H, Peluso S, Petkovic S, Petrucci S, Pezzoli G, Pimentel M, Pirker W, Pramstaller PP, Pulkes T, Puschmann A, Quattrone A, Raggio V, Ransmayr G, Rieder C, Riess O, Rodriguez-Porcel F, Rogaeva E, Ross OA, Ruiz-Martinez J, Sammler E, Luciano MS, Satake W, Saunders-Pullman R, Sazci A, Scherzer C, Schrag A, Schumacher-Schuh A, Sharma M, Sidransky E, Singleton AB, Petersen MS, Smolders S, Spitz M, Stefanis L, Struhal W, Sue C, Swan M, Swanberg M, Taba P, Taipa R, Tan M, Tan AH, Tan EK, Tang B, Tayebi N, Thaler A, Thomas A, Toda T, Toft M, Torres L, Tumas V, Valente EM, Van Broeckhoven C, Vecsei L, Velez-Pardo C, Vidailhet M, Vollstedt EJ, Warner TT, Williams-Gray CH, Winkelmann J, Woitalla D, Wood NW, Wszolek ZK, Wu RM, Wu YR, Xie T, Yoshino H, Zhang B, Zimprich A.

Author information
1
Institute of Neurogenetics, University of Luebeck, Luebeck, Germany.
2
Department of Psychiatry, University of Luebeck, Luebeck, Germany.


https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/ana.25514

Ignacio Fernández Mata. Investigador especializado en Parkinson en la Cleveland Clinic

«Los tratamientos personalizados mejorarán la calidad de vida de los enfermos de párkinson»

«Estamos mucho más cerca de poder curar esta enfermedad que cuando yo empecé a investigar hace quince años»

JOSÉ L. GONZÁLEZ GIJÓN.
Lunes, 27 agosto 2018, 02:22

https://www.elcomercio.es/sociedad/salud/tratamientos-personalizados-mejoraran-20180827001700-ntvo.html

Parkinson: la importancia de los genes

Nota en CNN en Español al Dr. Ignacio Fernandez Mata, director del Consorcio Latinoamericano para el Estudio de la Genética del Parkinson.


https://cnnespanol.cnn.com/video/parkinson-importancia-genes-latinos-geneticamente-diferente-vive-la-salud-cnnee/

Variable frequency of LRRK2 variants in the Latin American research consortium on the genetics of Parkinson’s disease (LARGE-PD), a case of ancestry

Salió la publicación con los resultados de LARGE-PD para mutaciones en LRRK2 en Latinoamérica del que somos participantes. A continuación tienen el resumen y siguiendo el link se accede al artículo completo.


Variable frequency of LRRK2 variants in the Latin American research consortium on the genetics of Parkinson’s disease (LARGE-PD), a case of ancestry

Mario Cornejo-Olivas1,2, Luis Torres3,4, Mario R. Velit-Salazar1,5, Miguel Inca-Martinez1, Pilar Mazzetti1,4, Carlos Cosentino3,4,Federico Micheli6, Claudia Perandones6, Elena Dieguez7, Victor Raggio8, Vitor Tumas9, Vanderci Borges10, Henrique B. Ferraz10,Carlos R. M. Rieder11, Artur Shumacher-Schuh11, Carlos Velez-Pardo12, Marlene Jimenez-Del-Rio12, Francisco Lopera12,Jorge Chang-Castello13, Brennie Andreé-Munoz14, Sarah Waldherr15,16, Dora Yearout15,16, Cyrus P. Zabetian15,16and Ignacio F. Mata15,16

1Neurogenetics Research Center, Instituto Nacional de Ciencias Neurologicas, Lima, Peru;2Northern Pacific Global Health Research Training Consortium, Bethesda, MD, USA;3Movement Disorders Unit, Instituto Nacional de Ciencias Neurologicas, Lima, Peru;4Universidad Nacional Mayor de San Marcos, Lima, Peru;5Universidad Peruana CayetanoHeredia, Lima, Peru;6Hospital de Clínicas José de San Martín, Universidad de Buenos Aires, Buenos Aires, Argentina;7Neurology Institute, Universidad de la Republica,Montevideo, Uruguay;8Department of Genetics, Facultad de Medicina, Universidad de la Republica, Montevideo, Uruguay;9Ribeirão Preto Medical School, Universidade de SãoPaulo, Ribeirão Preto, Brazil;10Movement Disorders Unit, Department of Neurology and Neurosurgery, Universidade Federal de São Paulo, São Paulo, SP, Brazil;11Hospital deClínicas de Porto Alegre, Porto Alegre, Brazil;12Neruroscience Research Group, Medical Research Institute, Universidad de Antioquia, Medellin, Colombia;13Department ofGenetics, School of Medici ne, Universidad de Guayaquil, Hospital Luis Vernaza, Guayaquil, Ecuador;14Service of Neurology, Hospital Luis Vernaza, Guayaquil, Ecuador;15VeteransAffairs Puget Sound Health Care System, University of Washington, Seattle, WA, USA and16Department of Neurology, University of Washington, Seattle, WA, USACorrespondence: Ignacio F . Mata (nachofm@uw.edu)

Mutations in Leucine Repeat Rich Kinase 2 (LRRK2), primarily located in codons G2019 and R1441, represent the most common genetic cause of Parkinson’s disease in European-derived populations. However, little is known about the frequency of these mutations in Latin American populations. In addition, a prior study suggested that a LRRK2 polymorphism (p.Q1111H) specific to Latino and Amerindian populations might be a risk factor for Parkinson’s disease, but this finding requires replication. We screened1734 Parkinson’s disease patients and 1097 controls enrolled in the Latin American Research Consortium on the Genetics of Parkinson’s disease (LARGE-PD), which includes sites in Argentina, Brazil, Colombia, Ecuador, Peru, and Uruguay. Genotypes were determined by TaqMan assay (p.G2019S and p.Q1111H) or by sequencing of exon 31 (p.R1441C/G/H/S). Admixture proportion was determined using a panel of 29 ancestry informative markers. We identified a total of 29 Parkinson’s disease patients (1.7%) who carried p.G2019S and the frequency ranged from 0.2% in Peru to 4.2% in Uruguay. Only two Parkinson’s disease patients carried p.R1441G and one patient carried p.R1441C. There was no significant difference in the frequency of p.Q1111H in patients (3.8%) compared to controls (3.1%; OR 1.02, p = 0.873). The frequency of LRRK2-p.G2019S varied greatly between different Latin American countries and was directly correlated with the amount of European ancestry observed. p.R1441G is rare in Latin America despite the large genetic contribution made by settlers from Spain, where the mutation is relatively common.
npj Parkinson’s Disease  (2017) 3:19  ; doi:10.1038/s41531-017-0020-6

http://rdcu.be/tb39

Las pruebas genéticas en la enfermedad de Parkinson

Publicado el 1 nov. 2016

Temas Calientes Presentador Dr. Ignacio Mata (España) habla de su estudio de las pruebas genéticas para la enfermedad de Parkinson en el 4º Congreso Mundial de Parkinson en Portland, Oregón.

Artículo sobre el trabajo de Nacho Mata en LARGE-PD.

Crossing Borders: Beyond the Euro-Centric Medical Research in Parkinson Disease
http://depts.washington.edu/mbwc/news/article/crossing-the-border-beyond-the-euro-centric-medical-research-in-parkinsons-

Artículo sobre el trabajo de Nacho Mata en LARGE-PD.

Simposio de Neurogenética en el Congreso Latinoamericano de Genética

Simposio de Neurogenética en el Congreso Latinoamericano de Genética

ALAG2016

Coordinadora: Leda Roche, Departamento de Genética, Facultad de Medicina, UdelaR.

Genética de la EP desde Seattle

The Power to be Precise
Cyrus Zabetian e Ignacio Fernandez Mata.

Un muy buen artículo sobre los últimos trabajos de este grupo con quienes tenemos el gusto de colaborar.

El artículo original recientemente publicado: GBA Variants are associated with a distinct pattern of cognitive deficits in Parkinson's disease. 

Linking PD Genes in a LARGE Way in Latin America

Linking PD Genes in a LARGE Way in Latin America.

APOE, MAPT, and SNCA Genes and Cognitive Performance in Parkinson Disease

APOE, MAPT, and SNCA Genes and Cognitive Performance in Parkinson Disease

Ignacio F. Mata, PhD1,3; James B. Leverenz, MD1,2,3,4,5; Daniel Weintraub, MD6,7,8; John Q. Trojanowski, MD, PhD9,10; Howard I. Hurtig, MD6; Vivianna M. Van Deerlin, MD, PhD9; Beate Ritz, MD, PhD11,12,13; Rebecca Rausch, PhD13; Shannon L. Rhodes, PhD11; Stewart A. Factor, DO14; Cathy Wood-Siverio, MS14; Joseph F. Quinn, MD15,16; Kathryn A. Chung, MD15,16; Amie L. Peterson, MD15,16; Alberto J. Espay, MD17; Fredy J. Revilla, MD17,18; Johnna Devoto, PsyD17; Shu-Ching Hu, MD, PhD1,2,3; Brenna A. Cholerton, PhD1,4; Jia Y. Wan, MS19,20; Thomas J. Montine, MD, PhD21; Karen L. Edwards, PhD19,20; Cyrus P. Zabetian, MD, MS1,2,3
[+] Author Affiliations

JAMA Neurol. 2014;71(11):1405-1412. doi:10.1001/jamaneurol.2014.1455. Text Size: A A A

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ABSTRACT

ABSTRACT | INTRODUCTION | METHODS | RESULTS | DISCUSSION | CONCLUSIONS | ARTICLE INFORMATION | REFERENCES

Importance  Cognitive impairment is a common and disabling problem in Parkinson disease (PD) that is not well understood and is difficult to treat. Identification of genetic variants that influence the rate of cognitive decline or pattern of early cognitive deficits in PD might provide a clearer understanding of the etiopathogenesis of this important nonmotor feature.

Objective  To determine whether common variation in the APOE, MAPT, and SNCA genes is associated with cognitive performance in patients with PD.

Design, Setting, and Participants  We studied 1079 PD patients from 6 academic centers in the United States who underwent assessments of memory (Hopkins Verbal Learning Test–Revised [HVLT-R]), attention and executive function (Letter-Number Sequencing Test and Trail Making Test), language processing (semantic and phonemic verbal fluency tests), visuospatial skills (Benton Judgment of Line Orientation test), and global cognitive function (Montreal Cognitive Assessment). Participants underwent genotyping for the APOE ε2/ε3/ε4 alleles, MAPT H1/H2 haplotypes, and SNCA rs356219. We used linear regression to test for association between genotype and baseline cognitive performance with adjustment for age, sex, years of education, disease duration, and site. We used a Bonferroni correction to adjust for the 9 comparisons that were performed for each gene.

Main Outcomes and Measures  Nine variables derived from 7 psychometric tests.

Results  The APOE ε4 allele was associated with lower performance on the HVLT-R Total Recall (P = 6.7 × 10−6; corrected P [Pc] = 6.0 × 10−5), Delayed Recall (P = .001; Pc = .009), and Recognition Discrimination Index (P = .004; Pc = .04); a semantic verbal fluency test (P = .002; Pc = .02); the Letter-Number Sequencing Test (P = 1 × 10−5; Pc = 9 × 10−5); and Trail Making Test B minus Trail Making Test A (P = .002; Pc = .02). In a subset of 645 patients without dementia, the APOE ε4 allele was associated with lower scores on the HVLT-R Total Recall (P = .005; Pc = .045) and the semantic verbal fluency (P = .005; Pc = .045) measures. Variants of MAPT and SNCA were not associated with scores on any tests.

Conclusions and Relevance  Our data indicate that the APOE ε4 allele is an important predictor of cognitive function in PD across multiple domains. Among PD patients without dementia, the APOE ε4 allele was only associated with lower performance on word list learning and semantic verbal fluency, a pattern more typical of the cognitive deficits seen in early Alzheimer disease than PD.

Charlas PRENPAR

Estos son los textos de las dos últimas charlas que di en el Hospital de Clínicas (Instituto de Neurología) en el marco del Programa PRENPAR. Las mismas se centran en los avances en proceso del Proyecto Genética de la Enfermedad de Parkinson.

Ambos fueron publicados en el libro anual del programa.

***

Genética y Enfermedad de Parkinson

En la charla de hoy me gustaría contarles sobre algunos aspectos generales de la Genética como disciplina y de sus aplicaciones en salud humana. De forma paralela, repasar algunos de los aspectos que hemos visto en varias oportunidades sobre genética y enfermedad de Parkinson (EP).

Herencia y variabilidad

La Genética es el estudio de la herencia y la variabilidad. Empieza analizando el parecido entre parientes, el cual se puede evidenciar tanto en la fisonomía y lo que vulgarmente llamamos el “parecido”, pero también se pueden evidenciar en el parecido en la forma de enfermar o de responder a la medicación. Es sabido que los hijos de un paciente con EP tienen por lo menos el doble de probabilidad de tener ellos la enfermedad, comparados con el resto de la población.
Por otro lado, la Genética, se centra en qué nos hace diferentes. En la variabilidad biológica. La que de nuevo, nos hace diferentes en nuestras susceptibilidades y resistencias a distintas afecciones, además de diferentes como individuos.

Mutaciones

La base molecular de esta variabilidad reside en los cambios del ADN. En las denominadas mutaciones. La gran mayoría de ellas son neutras, las portamos todos sin ninguna consecuencia negativa (e incluso a veces con efectos positivos), pero en algunos casos se convierten en determinantes fuertes de nuestras enfermedades. De hecho, en algunos individuos o familias, una mutación es el principal determinante de su salud, de su calidad de vida y de los cuidados médicos (y de otros tipos) que necesiten a lo largo de su vida. Hoy se conocen cientos de mutaciones en más de una decena de genes que pueden causar (o favorecer fuertemente la aparición de) EP.

La Genética y nosotros

La genética está de moda y por ende, vemos mucho de ella en los medios. Por otro lado, tiene mucho que decirnos sobre nosotros mismos, como especie y como individuos. Viejos problemas - como el origen del hombre- se ven hoy con nueva luz gracias a los estudios genómicos. ¿Sabían que todos tenemos algo de ADN de Neanderthal en nuestras células?

La genética y la medicina

Hay ya en el Talmud - compendio de leyes y tradiciones judías, del año 200 DC- descripciones de métodos para prevenir problemas derivados de enfermedades genéticas, en este caso particular, la hemofilia.
Hoy secuenciamos genomas enteros en busca de causas de enfermedades humanas. Se conocen miles de enfermedades causadas por mutaciones en distintos genes. Cada vez se conocen más y más variantes genéticas asociadas a enfermedades humanas y se trata de usar ese conocimiento para diagnosticar, prevenir y tratar las mismas. La EP no es la excepción. En varias oportunidades he mostrado los descubrimientos de genes y mutaciones causales o favorecedores de EP. Algunos de los cuales, incluso, se pueden estudiar en nuestro medio.
En la gran mayoría de los casos (incluida la EP) la relación entre genes y enfermedades no es sencilla. Uno no puede decirle “todo” a un paciente a partir de sus genes. En el mejor de los casos probabilidades o estimaciones para cada caso.

Biotecnología y salud

La ingeniería genética puede permitir desarrollar tratamientos a partir de genes (o fragmentos de genes). Desde 1990 se vienen probando estrategias de terapia génica con distinto grado de éxito. En EP se han iniciado recientemente con resultados potencialmente buenos pero que probablemente llevará tiempo que estén disponibles para nuestro uso.

***

Genética y Enfermedad de Parkinson

Actualización del proyecto de investigación (2007-2014)

Se detallan algunos avances y cómo proseguirá el proyecto de investigación del que formamos parte en genética de la enfermedad de Parkinson (EP). El mismo se desarrolla como parte de la red LARGE-PD, la cual está centralizada en Seattle, EEUU e incluye grupos de trabajo en Argentina, Brasil, Perú, Colombia, Uruguay y EEUU.
La participación de Uruguay se da como un proyecto conjunto de la Policlínica de Enfermedad de Parkinson y Movimientos Anormales del Instituto de Neurología, el Departamento de Genética de la Facultad de Medicina, el Centro de Medicina Nuclear del Hospital de Clínicas y el Geriatric Research Education and Clinical Center. Seattle, USA.
En el mismo se analizan aspectos de la Genética de la EP en la población de pacientes de Uruguay. En los pacientes ingresados, con diagnóstico clínico de EP, se analiza la historia familiar y la presentación clínica de la afección, se obtienen muestras de ADN para diagnósticos moleculares en genes vinculados a EP.
Este proyecto fue aprobado por el Comité de Ética del Hospital de Clínicas.
Se busca detectar mutaciones genéticas asociadas a la EP en nuestra población e investigar la existencia de nuevas mutaciones propias de nuestra región.
Actualmente, en Uruguay hemos alcanzado el hito de incluir 300 pacientes y 300 controles sanos al estudio. Esto implica el trabajo de mucha gente, en muchos casos de forma voluntaria y la colaboración de más de 600 individuos que han aportado sus datos y muestras de su ADN.
Ya contamos con datos moleculares de más de 250 paciente para el gen LRRK2 donde se evidencia que aproximadamente un 5% de los pacientes uruguayos con EP tienen como causa principal de su enfermedad una mutación en este gen. Mutaciones en este gen aparecen en cerca del 1% de los controles sanos. Por lo tanto, no todos los casos de EP son causados por este gen, ni todas las personas que tienen mutaciones en este gen tienen (o tendrán) EP. Se trata de una enfermedad muy compleja y cuyas causas recién están empezando a determinarse.
Además de los datos moleculares, se recaban datos epidemiológicos y de antecedentes familiares. De 291 pacientes con los que contamos con datos, 81 (27,8%) tiene algún familiar de primer o segundo grado con EP.

Actualmente se está intentando agrandar el estudio a nivel nacional en 3 aspectos:

1. Incorporando más pacientes; en los estudios de genética, en general, cuantos más pacientes participan los datos que se obtienen son más valiosos.
2. Realizando nuevos análisis sobre el genoma de los pacientes; se está empezando a estudiar, y esperamos contar con datos en los próximos meses, los genes GBA y SCNA en las muestras de pacientes uruguayos. Determinadas mutaciones en estos dos genes pueden ser factores de riesgo para el desarrollo de EP. Además, las mutaciones del gen GBA pueden causar una enfermedad genética, denominada enfermedad de Gaucher, la cual también se estudia en nuestro medio (fuera del Hospital de Clínicas y en una población en particular que son los individuos con ascendencia judía askenazi). Con este agregado se estudiarán los 3 genes que más frecuentemente actúan como factores de riesgo para EP.
3. Ampliando los aspectos clínicos de la EP en el estudio. Actualmente el Dr. Andrés Lescano se encuentra en EEUU y está realizando un estudio de problemas de memoria (mediante el MOCA) en pacientes con EP y correlacionando estos datos con los genes estudiados.
Esperamos en el 2015 contar con estos nuevos datos, tanto para los informes individuales como para el análisis de datos poblacionales que se difundirán en la comunidad científica.

Parkinson's disease Featured Researcher - Parkinson's Disease Foundation - Parkinson's Disease Foundation (PDF)

Parkinson's disease Featured Researcher - Parkinson's Disease Foundation - Parkinson's Disease Foundation (PDF)

Desafío aceptado

Ignacio Fernández Mata: desentrañando los misterios del Parkinson desde el Pacific Northwest

Miren esta nota a Nacho, con quien trabajamos en el proyecto de genética del Parkinson y de quien aprendimos mucho.

Ignacio Fernández Mata: desentrañando los misterios del Parkinson desde el Pacific Northwest.